Fue creado y desarrollado por Morten O. Alver y Nizad Batada en el año 2003, y es un proyecto cuya versión más reciente, la 2.7, data de agosto 2011. Está programado en Java y se puede utilizar en computadoras con los sistemas operativos Windows, Linux y Mac OS X.
Instalación:
En Windows, sólo es necesario descargarlo de la página oficial e instalarlo de forma directa.
Para la instalación en Ubuntu: Insertar el siguiente código en la consola
sudo apt-get install jabrefCómo usarlo:
En la ventana principal, en el icono

Luego de escoger el tipo de referencia que queremos agregar, lo único que tenemos que hacer es llenar los datos que nos pregunta (ver siguiente figura).
Nota: los datos dependen de la elección anterior
Aquí les comparto un video que me parece una buena, aunque breve, guía
El archivo que guardamos luego de escribir todas nuestras referencias es un archivo *.bib y a este es el que llamaremos cuando sea necesario.
Referencias bibliográficas en Lyx
En la ventana principal de nuestro documento Lyx vamos a
Insertar/ Índice / Bibliografía BibTex
y en "Añadir" le damos "Examinar" y buscamos el archivo *.bib que acabamos crear con JabRef, aceptamos y eso es todo, nuestra bibliografía ha sido agregado.
Nota (Tomado de Un bioinformatiquillo)
Podrán notar que en la ventana principal de JabRef está el símbolo de lyx,
este sirve para que al seleccionar algunas referencias, se inserten automáticamente en LyX.
Para ello, nos vamos a
Herramientas / Preferencias / Rutas / Tubería LyXServery en la casilla escribimos:
/home/[USUARIO]/.lyx/lyxpipe.
Tras reconfigurar (Herramientas / Reconfigurar) y reiniciar LyX, al pararse sobre alguna referencia (en JabRef) y pulsar el icono de Lyx, esta referencia se insertará inmediatamente en el documento.