domingo, 19 de febrero de 2012

JabRef



JabRef es un software gestor de referencias bibliográficas open source que utiliza el formato BibTex.

Fue creado y desarrollado por Morten O. Alver y Nizad Batada en el año 2003, y es un proyecto cuya versión más reciente, la 2.7, data de agosto 2011. Está programado en Java y se puede utilizar en computadoras con los sistemas operativos Windows, Linux y Mac OS X.

Instalación:

En Windows, sólo es necesario descargarlo de la página oficial e instalarlo de forma directa.

Para la instalación en Ubuntu: Insertar el siguiente código en la consola
sudo apt-get install  jabref
Cómo usarlo:


En la ventana principal, en el icono  adicionamos la entrada que deseamos. Las obciones son las siguientes:

Luego de escoger el tipo de referencia que queremos agregar, lo único que tenemos que hacer es llenar los datos que nos pregunta (ver siguiente figura).

Nota: los datos dependen de la elección anterior


Aquí les comparto un video que me parece una buena, aunque breve, guía 



El archivo que guardamos luego de escribir todas nuestras referencias es un archivo *.bib y a este es el que llamaremos cuando sea necesario.

Referencias bibliográficas en Lyx

En la ventana principal de nuestro documento Lyx vamos a 
Insertar/ Índice / Bibliografía BibTex


y en  "Añadir"  le damos "Examinar" y buscamos el archivo *.bib que acabamos crear con JabRef, aceptamos y eso es todo, nuestra bibliografía ha sido agregado.

Nota (Tomado de Un bioinformatiquillo) 

Podrán notar que en la ventana principal de JabRef está el símbolo de lyx,

este sirve para que al seleccionar algunas referencias, se inserten automáticamente en LyX.
Para ello, nos vamos a 
Herramientas / Preferencias / Rutas / Tubería LyXServer
 y en la casilla escribimos:
/home/[USUARIO]/.lyx/lyxpipe.
Tras reconfigurar (Herramientas / Reconfigurar) y reiniciar LyX, al pararse sobre alguna referencia (en JabRef) y pulsar el icono de Lyx, esta referencia se insertará inmediatamente en el documento.

martes, 14 de febrero de 2012

LaTeX Previewer

En esta entrada, quiero presentarles un potente editor de Latex Online, se trate de " LaTeX Previewer" desarrollado por el profesor Troy Henderson. Este editor permite correr código ".tex" sin la necesidad de tener instalado Latex en la computadora. Esto puede ser muy útil para visualizar de manera rápida algunas cosas, por ejemplo para trabajar con Tikz e ir corrigiendo los errores.

Enseguida les muestro una foto del entorno gráfico (hacer click sobre la imagen):


Características Generales


  • El preámbulo del documento ya está iniciado y tiene las siguientes opciones:

\documentclass{article}
\begin{document}
\thispagestyle{empty}
.
.
.
\end{document}

  • En el espacio en blanco podemos agregar el código que deseamos.
  • En el botón Packages hay una lista de paquetes que podemos agregar (muy útil por si no recordamos el nombre del paquete).

Luego que hemos compilado algo:
  • El  botón "PasteBin" nos abre otra ventana en donde está el código completo.
  • El botón "Poput" abre en una ventana emergente lo que hemos compilado.
  • En el menú desplegable "Download" escogemos el formato en el que deseamos descargar nuestro resultado.
Es una herramienta muy sencilla pero completa, ideal si lo que deseamos es revisar si algún código corto está bien escrito o para el diseño de imágenes. La única deficiencia que encuentro es que no podamos modificar la clase de  documento en la que estamos trabajando (pero no es muy importante).

Espero les sea útil.



lunes, 30 de enero de 2012

Gráficas en Latex

Todos sabemos lo complicado que en ocasiones es hacer gráficas en Latex, pero buscando por internet, me he encontrado con la página del profesor Troy Henderson, en la que de manera muy sencilla se pueden hacer gráficas como las siguientes:



Se trata de un entorno gráfico sencillo, el cual funciona a base del lenguaje de programación MetaPost, desarrollado por John Hobby. Y se puede utilizar de manera gratuita en la página www.tlhiv.org/mpgraph/ . El entorno gráfico es el siguiente (hacer click sobre la imagen):



Características Principales del Entorno

- En "Type of Graph" podemos escoger el tipo de gráfica que deseamos.
- En los espacios en blanco escribimos la fórmula de la función deseada.
- En el botón de opciones (en la parte inferior), podemos modificar bastantes cosas de las gráfica. Entre otras, el color, el nombre de los ejes, si queremos los ejes o no, la cuadrícula, etc. Las opciones dependen del tipo de gráfica que estamos realizando, en seguida mostraremos un ejemplo


- El botón "Preview" es para visualizar nuestros cambios.
- En el menú desplegable de la parte derecha inferior, que titula "Download". Podemos escoger el formato en el que queremos descargar la gráfica creada.

Espero que sea de mucha ayuda y ahorren mucho tiempo con esta forma de hacer gráficas.